La carrière de Flynn est injuste pour le bonhomme. Choisi juste après Rubio par Minnesota qui voulait assurer ses arrières au cas où l’Espagnol se fasse désirer, ce qui fut le cas, Flynn a effectué une saison remarquable pour un rookie avec plus de 13 pts et 4 passes de moyenne en 29 min. Néanmoins, sa saison sophomore est gâchée par de nombreux pépins, et il inscrira seulement 5 pts et 3 passes de moyenne en 53 matchs et 18 min de temps de jeu.

Les Wolves décident donc de s’en débarrasser avec l’arrivée de Rubio et ce sont les Rockets qui le recrutent. Entre temps, Kyle Lowry explose, et Goran Dragic confirme les espoirs placés en lui. Flynn devient donc le 3ème meneur, et n’a joué que 7 matchs pour 11 min de temps de jeu de moyenne, avec une triste moyenne de 3 pts.

Cependant, certaines équipes n’oublient pas le talent du joueur et des offres de transfert commencent à arriver aux oreilles des Rockets.

Ainsi, Mike Bibby et Renaldo Balkman ont été proposé à Houston de la part de New York. Pas suffisant pour les Rockets.

Les Lakers ont montré leur intérêt pour le joueur mais aucune offre concrète n’a été faite.

Dans tous les cas, Jonny Flynn sera surement ravi de voir qu’il n’est pas oublié, et qu’il pourra enfin abandonner son rôle de 3ème meneur.